BeliefNetwork

namespace: SMRUCC.genomics.Analysis.ProteinTools.Interactions

Methods

Convert

1
SMRUCC.genomics.Analysis.ProteinTools.Interactions.BeliefNetwork.Convert(SMRUCC.genomics.Analysis.ProteinTools.Interactions.SequenceAssembler.AlignmentColumn[],SMRUCC.genomics.Analysis.ProteinTools.Interactions.SequenceAssembler.AlignmentColumn)
Parameter Name Remarks
SubjectColumns Entity.Properties
TargetColumn Entity.Class

GenerateBlankVector

1
SMRUCC.genomics.Analysis.ProteinTools.Interactions.BeliefNetwork.GenerateBlankVector(System.Int32)

使用-1来填充空白的序列区块

Parameter Name Remarks
Width -

GenerateNetwork

1
SMRUCC.genomics.Analysis.ProteinTools.Interactions.BeliefNetwork.GenerateNetwork(SMRUCC.genomics.Analysis.ProteinTools.Interactions.SequenceAssembler.AlignmentColumn[])
Parameter Name Remarks
Data -

returns: 假设其网络结构为线性的

GetBelief

1
SMRUCC.genomics.Analysis.ProteinTools.Interactions.BeliefNetwork.GetBelief(System.String[],System.String[])
Parameter Name Remarks
Proteins 蛋白质序列的排列顺序必须与计算网络时候所使用的比对序列的位置相一致,对于空白的部分请使用一个空字符串
ProteinsConditions 蛋白质序列的排列顺序必须与计算网络时候所使用的比对序列的位置相一致,对于空白的部分请使用一个空字符串

假设没有缺失的序列部分,并且在这里将空缺转换为-1