LociExtensions

namespace: SMRUCC.genomics.Analysis.SequenceTools.SequencePatterns

将序列特征的搜索结果转换为@”T:SMRUCC.genomics.SequenceModel.NucleotideModels.SimpleSegment”对象类型

Methods

ConvertsAuto

1
SMRUCC.genomics.Analysis.SequenceTools.SequencePatterns.LociExtensions.ConvertsAuto(Microsoft.VisualBasic.DocumentFormat.Csv.DocumentStream.File)

自动根据类型转换为位点数据

Parameter Name Remarks
df -

MirrorsLoci

1
SMRUCC.genomics.Analysis.SequenceTools.SequencePatterns.LociExtensions.MirrorsLoci(SMRUCC.genomics.Analysis.SequenceTools.SequencePatterns.Topologically.PalindromeLoci)

—><—

Parameter Name Remarks
x -

ToLoci

1
SMRUCC.genomics.Analysis.SequenceTools.SequencePatterns.LociExtensions.ToLoci(SMRUCC.genomics.Analysis.SequenceTools.SequencePatterns.Topologically.Repeats,System.Int32)

对于简单的重复序列而言,正向链上面的重复片段,例如AAGTCT在反向链上面就是AGACTT,总是可以找得到对应的,所以在这里只需要记录下正向链的数据就好了

Parameter Name Remarks
x -
start -