RepeatsSearchs

namespace: SMRUCC.genomics.Analysis.SequenceTools.SequencePatterns.Topologically

Methods

__beginInit

1
SMRUCC.genomics.Analysis.SequenceTools.SequencePatterns.Topologically.RepeatsSearchs.__beginInit(Microsoft.VisualBasic.List{System.String}@)

只搜索出现的序列片段,假若短片段就已经不存在于序列之上,则后面的延伸序列肯定也不存在,则删除这部分的序列

Parameter Name Remarks
seeds -

__postResult

1
SMRUCC.genomics.Analysis.SequenceTools.SequencePatterns.Topologically.RepeatsSearchs.__postResult(System.String[],Microsoft.VisualBasic.List{System.String},System.Int32)

虽然当前的片段没有在序列上面出现,但是上一次迭代的片段却是出现的,假若序列片段没有匹配上,则上一次迭代的序列则可能为重复序列

Parameter Name Remarks
currentStat -

Properties

CountStatics

片段按照长度的数量上的分布情况