Transcript

_namespace: SMRUCC.genomics.Interops.NBCR.MEME_Suite.DocumentFormat_

转录本对象,包含有基本的基因结构:ATG-TGA,TSSs,TTS以及链的方向,表达量的高低

Methods

Copy``1

1
SMRUCC.genomics.Interops.NBCR.MEME_Suite.DocumentFormat.Transcript.Copy``1(SMRUCC.genomics.Assembly.NCBI.GenBank.TabularFormat.ComponentModels.GeneBrief)

单个的ORF

CreateObject``1

1
SMRUCC.genomics.Interops.NBCR.MEME_Suite.DocumentFormat.Transcript.CreateObject``1(SMRUCC.genomics.ComponentModel.Loci.NucleotideLocation)

要确保左小右大

Parameter Name Remarks
contig -

Properties

Left

@”T:SMRUCC.genomics.SequenceModel.NucleotideModels.Contig”.Left (The transcription start coordinate.)

Position

位点和基因对象之间的位置关系的简要描述

Raw

Htseq-Count raw/GeneLength

@”T:SMRUCC.genomics.SequenceModel.NucleotideModels.Contig”.Right (The transcription stop coordinate.)

Strand

@”T:SMRUCC.genomics.SequenceModel.NucleotideModels.Contig”.Strands

TSSsShared

5’UTR左端的共享的reads计数