v228

namespace: SMRUCC.genomics.Interops.NCBI.Extensions.LocalBLAST.BLASTOutput.BlastPlus

2.2.28版本的BLAST+程序的日志输出文件

默认的文件编码是@”P:System.Text.Encoding.UTF8”

Methods

__generateLine

1
SMRUCC.genomics.Interops.NCBI.Extensions.LocalBLAST.BLASTOutput.BlastPlus.v228.__generateLine(SMRUCC.genomics.Interops.NCBI.Extensions.LocalBLAST.BLASTOutput.BlastPlus.Query,System.Double,System.Double)

导出最佳的符合条件的

Parameter Name Remarks
query -
coverage -
identities -

CheckIntegrity

1
SMRUCC.genomics.Interops.NCBI.Extensions.LocalBLAST.BLASTOutput.BlastPlus.v228.CheckIntegrity(SMRUCC.genomics.SequenceModel.FASTA.FastaFile)

根据Query检查完整性

Parameter Name Remarks
QuerySource 主要是使用到Query序列之中的Title属性

ExportAllBestHist

1
SMRUCC.genomics.Interops.NCBI.Extensions.LocalBLAST.BLASTOutput.BlastPlus.v228.ExportAllBestHist(System.Double,System.Double)

Exports all of the hits which it meet the condition of threshold.(导出所有的单项最佳)

ExportBestHit

1
SMRUCC.genomics.Interops.NCBI.Extensions.LocalBLAST.BLASTOutput.BlastPlus.v228.ExportBestHit(System.Double,System.Double)

从本日志文件之中导出BestHit表格(单项最佳的)

ExportOverview

1
SMRUCC.genomics.Interops.NCBI.Extensions.LocalBLAST.BLASTOutput.BlastPlus.v228.ExportOverview

不做任何筛选,导出所有的比对信息

SBHLines

1
SMRUCC.genomics.Interops.NCBI.Extensions.LocalBLAST.BLASTOutput.BlastPlus.v228.SBHLines(SMRUCC.genomics.Interops.NCBI.Extensions.LocalBLAST.BLASTOutput.BlastPlus.Query,System.Double,System.Double)

导出所有符合条件的

Parameter Name Remarks
Query -
coverage -
identities -