Contig

namespace: SMRUCC.genomics.SequenceModel

Methods

AssemblingForward

1
SMRUCC.genomics.SequenceModel.Contig.AssemblingForward(Microsoft.VisualBasic.List{SMRUCC.genomics.SequenceModel.SAM.AlignmentReads},System.Boolean)

所装配出来的位置和方向有关

Parameter Name Remarks
Reads -
Reversed 实际的方向

AssemblingReversed

1
SMRUCC.genomics.SequenceModel.Contig.AssemblingReversed(Microsoft.VisualBasic.List{SMRUCC.genomics.SequenceModel.SAM.AlignmentReads},System.Boolean)

不明白在bitwiseFLAG里面已经标注了Reverse方向了,为什么还是有些Reads会是正向的
bwa标注出来的位置和ncbi上面的blast的位置好像不一致???

Parameter Name Remarks
Reads 位置从大到小的